Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIF1Q5UIP0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIF1Q5UIP0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms