Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.2 ms