Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2LQ5T4T6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2LQ5T4T6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms