Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms