Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAPCD1Q5SSQ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms