Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1JQ5JR12 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1JQ5JR12 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1JQ5JR12 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1JQ5JR12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPM1JQ5JR12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms