Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAVIN4Q5BKX8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAVIN4Q5BKX8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAVIN4Q5BKX8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms