Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN4Q56A73 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN4Q56A73 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms