Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCU0

Putative uncharacterized protein FLJ37770, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3ZCU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q3ZCU0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3ZCU0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms