Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BBS9Q3SYG4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms