Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP20-2Q3LI61 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-2Q3LI61 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms