Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL38Q2WGJ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms