Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms