Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHQ16836 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHQ16836 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHQ16836 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHQ16836 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHQ16836 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHQ16836 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHQ16836 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHQ16836 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHQ16836 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHQ16836 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHQ16836 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHQ16836 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHQ16836 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHQ16836 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHQ16836 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHQ16836 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHQ16836 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHQ16836 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHQ16836 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHQ16836 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHQ16836 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHQ16836 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHQ16836 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHQ16836 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHQ16836 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHQ16836 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHQ16836 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHQ16836 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHQ16836 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHQ16836 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHQ16836 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHQ16836 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHQ16836 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHQ16836 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHQ16836 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHQ16836 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHQ16836 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHQ16836 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHQ16836 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHQ16836 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHQ16836 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHQ16836 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHQ16836 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHQ16836 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHQ16836 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHQ16836 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHQ16836 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHQ16836 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHQ16836 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHQ16836 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHQ16836 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHQ16836 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHQ16836 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHQ16836 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms