Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK4Q16654 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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