Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMN1Q16637 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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