Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD1Q15797 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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