Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM1Q15629 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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