Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CNN3Q15417 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CNN3Q15417 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CNN3Q15417 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNN3Q15417 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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