Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.594e-9■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-214ENST00000521314 1555 ntTSL 531.03■■■□□ 2.562e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.482e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-224ENST00000523562 1839 ntTSL 230.24■■■□□ 2.432e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 SRRM1-222ENST00000596378 2314 ntTSL 1 (best)30.19■■■□□ 2.429e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-222ENST00000522870 1599 ntTSL 529.57■■■□□ 2.322e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.222e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-220ENST00000522295 1539 ntTSL 528.66■■■□□ 2.182e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-201ENST00000434833 1568 ntTSL 1 (best)28.35■■■□□ 2.132e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-203ENST00000517685 1249 ntTSL 528.32■■■□□ 2.122e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.112e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-216ENST00000521624 1358 ntTSL 1 (best)26.26■■□□□ 1.792e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 NRBP2-206ENST00000530347 1037 ntTSL 525.21■■□□□ 1.632e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-218ENST00000522023 636 ntTSL 424.6■■□□□ 1.532e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HSF4-223ENST00000523077 828 ntTSL 224.09■■□□□ 1.452e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CARS-209ENST00000470221 2466 ntTSL 223.87■■□□□ 1.412e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CARS-208ENST00000466442 2671 ntTSL 223.24■■□□□ 1.312e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.252e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 NRBP2-209ENST00000533093 3877 ntTSL 1 (best)22.43■■□□□ 1.182e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 NRBP2-204ENST00000529747 3693 ntTSL 222.19■■□□□ 1.142e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.032e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 AC074143.1-202ENST00000518753 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.43■□□□□ 0.862e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.844e-9■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.674e-9■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.542e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.529e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CARS-212ENST00000526890 5732 ntTSL 215.01□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CCPG1-201ENST00000310958 6822 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.089e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CARS-215ENST00000531387 2805 ntTSL 214.14□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CARS-210ENST00000484484 1151 ntTSL 513.24□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.449e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.559e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 SRRM1-204ENST00000461768 496 ntTSL 311.23□□□□□ -0.619e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 AC079801.1-201ENST00000623753 388 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.669e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 SRRM1-214ENST00000485541 679 ntTSL 510.54□□□□□ -0.729e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 SRRM1-220ENST00000496882 834 ntTSL 510.32□□□□□ -0.769e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 SRRM1-212ENST00000479034 2671 ntTSL 59.63□□□□□ -0.879e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 MKI67-203ENST00000464771 692 ntTSL 38.69□□□□□ -1.029e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.159e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CCPG1-211ENST00000568808 2866 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.159e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CCPG1-208ENST00000568372 3388 ntTSL 1 (best)7.59□□□□□ -1.29e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.279e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HOXB3-213ENST00000552000 466 ntTSL 36.83□□□□□ -1.324e-9■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.329e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.359e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.49e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.99e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.26□□□□□ -2.212e-6■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 CCPG1-209ENST00000568543 721 ntTSL 30.84□□□□□ -2.279e-8■■□□□ 12.8
WDR43Q15061 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 525.09■■□□□ 1.611e-10■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 224.54■■□□□ 1.521e-10■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPM-211ENST00000598603 784 ntTSL 224.37■■□□□ 1.491e-10■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 ACSM3-203ENST00000501740 839 ntTSL 518.34■□□□□ 0.531e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 415.87■□□□□ 0.131e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 415.29■□□□□ 0.041e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 522.88■■□□□ 1.252e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.12e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 521.81■■□□□ 1.082e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 521.5■■□□□ 1.032e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.762e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.822e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 512.98□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 HNRNPU-202ENST00000366525 2851 ntTSL 512.52□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 223.46■■□□□ 1.355e-7■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 23.8□□□□□ -1.81e-14■■□□□ 12.7
WDR43Q15061 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 15e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 SEMA4C-206ENST00000482925 3776 ntTSL 217.75■□□□□ 0.435e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 230.6■■■□□ 2.493e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 330.6■■■□□ 2.493e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.433e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.423e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 529.84■■■□□ 2.373e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.333e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.033e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.853e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.723e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 325.52■■□□□ 1.683e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.523e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.453e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.453e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 523.44■■□□□ 1.343e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 222.91■■□□□ 1.263e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 322.91■■□□□ 1.263e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.263e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 522.38■■□□□ 1.173e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.153e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 320.98■□□□□ 0.953e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.863e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 320.41■□□□□ 0.863e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 520.13■□□□□ 0.813e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.761e-6■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 219.47■□□□□ 0.713e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-210ENST00000525223 610 ntTSL 319.25■□□□□ 0.673e-7■■□□□ 12.6
WDR43Q15061 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.613e-7■■□□□ 12.6
Retrieved 100 of 3,951 protein–RNA pairs in 66.6 ms