Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPHQ15003 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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