Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN4

KRT72, Keratin, type II cytoskeletal 72, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT72Q14CN4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT72Q14CN4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT72Q14CN4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT72Q14CN4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT72Q14CN4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT72Q14CN4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT72Q14CN4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms