Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDC1Q14676 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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