Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms