Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1CQ14123 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1CQ14123 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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