Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1DQ13901 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1DQ13901 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1DQ13901 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1DQ13901 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1DQ13901 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1DQ13901 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1DQ13901 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1DQ13901 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1DQ13901 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1DQ13901 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1DQ13901 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1DQ13901 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1DQ13901 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1DQ13901 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1DQ13901 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1DQ13901 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1DQ13901 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1DQ13901 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1DQ13901 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1DQ13901 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1DQ13901 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1DQ13901 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1DQ13901 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1DQ13901 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C1DQ13901 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1DQ13901 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1DQ13901 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1DQ13901 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1DQ13901 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1DQ13901 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1DQ13901 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1DQ13901 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1DQ13901 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1DQ13901 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1DQ13901 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1DQ13901 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1DQ13901 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1DQ13901 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1DQ13901 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1DQ13901 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1DQ13901 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1DQ13901 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1DQ13901 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1DQ13901 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1DQ13901 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1DQ13901 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1DQ13901 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1DQ13901 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1DQ13901 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1DQ13901 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1DQ13901 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1DQ13901 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C1DQ13901 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1DQ13901 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1DQ13901 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1DQ13901 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1DQ13901 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1DQ13901 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1DQ13901 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1DQ13901 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C1DQ13901 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1DQ13901 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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