Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX1Q13596 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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