Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTM1Q13496 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTM1Q13496 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms