Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140Q13342 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140Q13342 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140Q13342 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140Q13342 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140Q13342 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140Q13342 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140Q13342 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140Q13342 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140Q13342 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140Q13342 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140Q13342 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140Q13342 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140Q13342 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140Q13342 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140Q13342 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140Q13342 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140Q13342 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140Q13342 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140Q13342 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140Q13342 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140Q13342 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140Q13342 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140Q13342 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140Q13342 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140Q13342 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140Q13342 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140Q13342 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140Q13342 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140Q13342 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140Q13342 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140Q13342 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140Q13342 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140Q13342 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140Q13342 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140Q13342 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140Q13342 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140Q13342 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140Q13342 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140Q13342 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140Q13342 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140Q13342 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140Q13342 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140Q13342 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140Q13342 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140Q13342 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SP140Q13342 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP140Q13342 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP140Q13342 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP140Q13342 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP140Q13342 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140Q13342 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140Q13342 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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