Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3BQ13214 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3BQ13214 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms