Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP4Q13115 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP4Q13115 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP4Q13115 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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