Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHAF1AQ13111 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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