Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK2Q13002 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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