Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL4Q0D2K0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIPAL4Q0D2K0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms