Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TGM3Q08188 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM3Q08188 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms