Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD51Q06609 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51Q06609 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms