Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms