Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FPGSQ05932 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FPGSQ05932 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FPGSQ05932 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms