Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RELQ04864 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELQ04864 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELQ04864 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELQ04864 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELQ04864 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELQ04864 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELQ04864 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RELQ04864 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELQ04864 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELQ04864 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RELQ04864 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RELQ04864 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELQ04864 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELQ04864 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELQ04864 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RELQ04864 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELQ04864 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELQ04864 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELQ04864 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELQ04864 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELQ04864 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELQ04864 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELQ04864 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELQ04864 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELQ04864 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELQ04864 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELQ04864 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELQ04864 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELQ04864 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RELQ04864 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELQ04864 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELQ04864 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms