Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 PTK2YJR059W 2457 nt5.9□□□□□ -1.46
SND1Q04007 FPK1YNR047W 2682 nt5.9□□□□□ -1.46
SND1Q04007 LUC7YDL087C 786 nt5.9□□□□□ -1.46
SND1Q04007 YER010CYER010C 705 nt5.9□□□□□ -1.46
SND1Q04007 KSS1YGR040W 1107 nt5.9□□□□□ -1.46
SND1Q04007 MRT4YKL009W 711 nt5.9□□□□□ -1.46
SND1Q04007 STM1YLR150W 822 nt5.9□□□□□ -1.46
SND1Q04007 AMA1YGR225W 1782 nt5.9□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.89□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YCL065WYCL065W 369 nt5.89□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt5.89□□□□□ -1.47
SND1Q04007 PAN6YIL145C 930 nt5.89□□□□□ -1.47
SND1Q04007 NTR2YKR022C 969 nt5.89□□□□□ -1.47
SND1Q04007 RPS0BYLR048W 759 nt5.89□□□□□ -1.47
SND1Q04007 PDR16YNL231C 1056 nt5.89□□□□□ -1.47
SND1Q04007 SUI3YPL237W 858 nt5.89□□□□□ -1.47
SND1Q04007 PAF1YBR279W 1338 nt5.89□□□□□ -1.47
SND1Q04007 RET1YOR207C 3450 nt5.89□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YEH1YLL012W 1722 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 KEL1YHR158C 3495 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 QDR3YBR043C 2070 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YDL172CYDL172C 480 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YGL101WYGL101W 648 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 SYF2YGR129W 648 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 CBP4YGR174C 513 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 CAB4YGR277C 918 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 APS3YJL024C 585 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 DAN1YJR150C 897 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 ENV9YOR246C 993 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 SKN1YGR143W 2316 nt5.88□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YML082WYML082W 1950 nt5.87□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.87□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YRA1YDR381W 681 nt5.87□□□□□ -1.47
SND1Q04007 SEC20YDR498C 1152 nt5.87□□□□□ -1.47
SND1Q04007 TIM21YGR033C 720 nt5.87□□□□□ -1.47
SND1Q04007 RPS31YLR167W 459 nt5.87□□□□□ -1.47
SND1Q04007 SSK22YCR073C 3996 nt5.87□□□□□ -1.47
SND1Q04007 ALT1YLR089C 1779 nt5.87□□□□□ -1.47
SND1Q04007 ATO3YDR384C 828 nt5.86□□□□□ -1.47
SND1Q04007 ERG26YGL001C 1050 nt5.86□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YOL131WYOL131W 327 nt5.86□□□□□ -1.47
SND1Q04007 VPS28YPL065W 729 nt5.86□□□□□ -1.47
SND1Q04007 THI22YPR121W 1719 nt5.85□□□□□ -1.47
SND1Q04007 ATP1YBL099W 1638 nt5.85□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YEL074WYEL074W 339 nt5.85□□□□□ -1.47
SND1Q04007 GLE2YER107C 1098 nt5.85□□□□□ -1.47
SND1Q04007 DSD1YGL196W 1287 nt5.85□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YNG2YHR090C 849 nt5.85□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YLR036CYLR036C 612 nt5.85□□□□□ -1.47
SND1Q04007 CSG2YBR036C 1233 nt5.85□□□□□ -1.47
SND1Q04007 SRB6YBR253W 366 nt5.85□□□□□ -1.47
SND1Q04007 SFB3YHR098C 2790 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YDL109CYDL109C 1944 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 ZRC1YMR243C 1329 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YDL057WYDL057W 987 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YDL119CYDL119C 924 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 MRPL7YDR237W 879 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 ARD1YHR013C 717 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 MRPL22YNL177C 930 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 MRL1YPR079W 1146 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 MLC2YPR188C 492 nt5.84□□□□□ -1.47
SND1Q04007 YDR249CYDR249C 1122 nt5.83□□□□□ -1.48
SND1Q04007 SUA5YGL169W 1281 nt5.83□□□□□ -1.48
SND1Q04007 XPT1YJR133W 630 nt5.83□□□□□ -1.48
SND1Q04007 ROT1YMR200W 771 nt5.83□□□□□ -1.48
SND1Q04007 CSL4YNL232W 879 nt5.83□□□□□ -1.48
SND1Q04007 LTO1YNL260C 597 nt5.83□□□□□ -1.48
SND1Q04007 SFT2YBL102W 648 nt5.83□□□□□ -1.48
SND1Q04007 ARO9YHR137W 1542 nt5.83□□□□□ -1.48
SND1Q04007 TMN2YDR107C 2019 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 SAC6YDR129C 1929 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 YDL144CYDL144C 1071 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 SNZ3YFL059W 897 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 CIA2YHR122W 696 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 MTC2YKL098W 1074 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 SNZ2YNL333W 897 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 RBD2YPL246C 789 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 SUE1YPR151C 621 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 SAS10YDL153C 1833 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 HXT5YHR096C 1779 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 PCL8YPL219W 1479 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 SHM1YBR263W 1473 nt5.82□□□□□ -1.48
SND1Q04007 MID1YNL291C 1647 nt5.81□□□□□ -1.48
SND1Q04007 CDC19YAL038W 1503 nt5.81□□□□□ -1.48
SND1Q04007 SIR1YKR101W 1965 nt5.81□□□□□ -1.48
SND1Q04007 CHO1YER026C 831 nt5.81□□□□□ -1.48
SND1Q04007 PCT1YGR202C 1275 nt5.81□□□□□ -1.48
SND1Q04007 YLF2YHL014C 1218 nt5.81□□□□□ -1.48
SND1Q04007 YKR047WYKR047W 306 nt5.81□□□□□ -1.48
SND1Q04007 YPR015CYPR015C 744 nt5.81□□□□□ -1.48
SND1Q04007 UTP7YER082C 1665 nt5.81□□□□□ -1.48
SND1Q04007 SMF2YHR050W 1650 nt5.81□□□□□ -1.48
SND1Q04007 VHT1YGR065C 1782 nt5.8□□□□□ -1.48
SND1Q04007 HST1YOL068C 1512 nt5.8□□□□□ -1.48
SND1Q04007 RSC30YHR056C 2652 nt5.8□□□□□ -1.48
SND1Q04007 VBA1YMR088C 1689 nt5.8□□□□□ -1.48
SND1Q04007 YDR154CYDR154C 351 nt5.8□□□□□ -1.48
SND1Q04007 YGR022CYGR022C 330 nt5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms