Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms