Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms