Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB2Q03252 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms