Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A11Q02978 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms