Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB1Q02641 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms