Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR2Q01850 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms