Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
XPCQ01831 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
XPCQ01831 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
XPCQ01831 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
XPCQ01831 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
XPCQ01831 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
XPCQ01831 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
XPCQ01831 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
XPCQ01831 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
XPCQ01831 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
XPCQ01831 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
XPCQ01831 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
XPCQ01831 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
XPCQ01831 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
XPCQ01831 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
XPCQ01831 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
XPCQ01831 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
XPCQ01831 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
XPCQ01831 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
XPCQ01831 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
XPCQ01831 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
XPCQ01831 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
XPCQ01831 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
XPCQ01831 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
XPCQ01831 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
XPCQ01831 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
XPCQ01831 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
XPCQ01831 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
XPCQ01831 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
XPCQ01831 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
XPCQ01831 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
XPCQ01831 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
XPCQ01831 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
XPCQ01831 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
XPCQ01831 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
XPCQ01831 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
XPCQ01831 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
XPCQ01831 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
XPCQ01831 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
XPCQ01831 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
XPCQ01831 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
XPCQ01831 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
XPCQ01831 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
XPCQ01831 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
XPCQ01831 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
XPCQ01831 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
XPCQ01831 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
XPCQ01831 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
XPCQ01831 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
XPCQ01831 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
XPCQ01831 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
XPCQ01831 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
XPCQ01831 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
XPCQ01831 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
XPCQ01831 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
XPCQ01831 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
XPCQ01831 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
XPCQ01831 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
XPCQ01831 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
XPCQ01831 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
XPCQ01831 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
XPCQ01831 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
XPCQ01831 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
XPCQ01831 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
XPCQ01831 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
XPCQ01831 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
XPCQ01831 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
XPCQ01831 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
XPCQ01831 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
XPCQ01831 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
XPCQ01831 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
XPCQ01831 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
XPCQ01831 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
XPCQ01831 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
XPCQ01831 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
XPCQ01831 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
XPCQ01831 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
XPCQ01831 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
XPCQ01831 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 521 ms