Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EXOSC10Q01780 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC10Q01780 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms