Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFITM3Q01628 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms