Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF9Q00978 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms